Els Parcs marins de Catalunya, el Parc Natural de Cap de Creus i el Parc Natural del Montgrí, les illes Medes i el Baix Ter, son unes de les àrees marines protegides més emblemàtiques de la Mediterrània nord-occidental, amb un patrimoni natural únic, però molt sensible a tot tipus d’impactes.
El seguiment del patrimoni natural dels Parcs marins de Catalunya té el seu origen l’any 1990, amb la monitorització de la biodiversitat de la Reserva Marina de les Illes Medes, i que l’any 1998, es va ampliar al PN del Cap de Creus. Aquest seguiment es un dels més llargs i constants de la Mediterrània, i representa una eina indispensable per entendre els canvis ocorreguts a llarg terme en les espècies i comunitats marines, i les seves causes i conseqüències.
L’actual programa de Seguiment de la biodiversitat marina als espais marins protegits de Catalunya està coordinat des de la Universitat de Barcelona, amb la participació d‘altres institucions i centres de recerca, com el CSIC o IEO, i està encarregat i finançat pel Departament de Territori i Sostenibilitat de la Generalitat de Catalunya.